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12 setiembre
Dr. Andres Puime

Detección de patógenos respiratorios por métodos de biología molecular en casos de Enfermedad Tipo Influenza

La detección de patógenos respiratorios por biología molecular se realiza en el laboratorio de Análisis Clínico LAC, mediante dos plataformas de PCR en tiempo real; la plataforma multiparamétrica FilmArray® / Panel Respiratorio y el sistema GeneXpert_Flu / RSV. La utilización de una u otra metodología de diagnóstico depende de la orientación y el contexto clínico de cada caso en particular. Independientemente de ello, la introducción de estas herramientas diagnósticas desde hace ya algunos años ha permitido al laboratorio, identificar con gran precisión la etiología de las infecciones respiratorias tan características de los meses invernales. A su vez estas metodologías permiten brindar a los prestadores y al público en general la información de las frecuencias de las principales etiologías de patógenos respiratorios observada en la población de usuarios del LAC. Durante el periodo invernal de mayor transmisión de enfermedades respiratorias, el LAC elabora un informe semanal con el objetivo de contribuir a la toma de decisiones de nuestros prestadores.

Los resultados de la detección de patógenos respiratorios en la plataforma FilmArray® para el año 2018 están representados en el gráfico 1. A título comparativo en el gráfico 2 figuran las frecuencias etiológicas observadas en el año 2017 para el mismo periodo de tiempo.

Semana 26 (24 al 30 de junio 2018)

En el otoño 2018 comienzan a detectarse a partir de la semana 20 (13 al 19 de mayo) los primeros casos de Virus Respiratorio Sincicial (VRS) y de virus Parainfluenza. En la semana 22, aparece de manera sostenida la detección de los Coronavirus, en particular el Coronavirus HKU1. Estos tres virus constituyen los principales virus detectados como reflejo del aumento de la transmisión de los virus respiratorios en la época fría del año.

A título comparativo, en el mismo periodo del año 2017 ya circulaba con importante frecuencia los virus Influenza tanto Influenza A como Influenza B.

En este año, los virus de la gripe están por empezar a circular en su típico periodo invernal. El efecto protector de la inmunización temprana de la población y la circulación más tardía de los virus influenza podrán mitigar su transmisión en las próximas semanas.

Gráfico 1 - 2018
Gráfico 2 - 2017

Semana 33 (12 al 18 de agosto de 2018)

A partir de la semana 20 (13 al 19 de mayo) comienza una intensa circulación de virus respiratorios en particular el Virus Respiratorio Sincicial (VRS), los virus Parainfluenza y en menor medida el grupo de Coronavirus. En la semana 28, se comienza a detectar los diferentes virus Influenza (Influenza A H3, Influenza A H1 e Influenza B). En la semana 31 (del 29/07al 4 de agosto) observamos ya una intensa circulación de los virus gripales cuya proporción se incrementa aún más en las semanas 32 y 33 (12 al 18 de agosto) correspondiendo al pico de frecuencia de los virus gripales. A tÍtulo comparativo, en el año 2017 el pico de circulación de los virus influenza correspondió al periodo situado entre la semana 23 y 28.

Entre los virus gripales identificados el 44% correspondió a Influenza A H1, el 35 % a Influenza B, el 19% a Influenza A H3 y el 2% a virus Influenza A no tipificados. La mediana de edad de los casos de Influenza A H1 es de 10 años con un percentil 25 (p25) de 5 años y un percentil 75 (p75) de 38 años. Para los casos de Influenza A H3 la mediana es de 7 años y la distribución es de 3 y 10 años para el p25 y p75 respectivamente. Los casos de Influenza B integran un grupo de mayor edad con una mediana de 15 años, p25 de 8 años y p75 de 46 años.

El aumento de la circulación de los virus gripales se acompaña de un franco descenso en la detección del VRS y un aumento de casos detectados con metapneumovirus cuya proporción alcanza el 12% de los virus respiratorios identificados en la semana 33.

Gráfico 1 - 2018
Gráfico 2 - 2017

Semana 34 (19 al 25 de agosto de 2018)

A partir de la semana 20 (13 al 19 de mayo) comienza una intensa circulación de virus respiratorios en particular el Virus Respiratorio Sincicial (VRS), los virus Parainfluenza y en menor medida el grupo de Coronavirus. En la semana 28, se comienza a detectar los diferentes virus Influenza (Influenza A H3, Influenza A H1 e Influenza B). En la semana 31 (del 29/07 al 4 de agosto) observamos ya una intensa circulación de los virus gripales cuya proporción se incrementa aún más entre las semanas 32 a 34 (12 al 25 de agosto) correspondiendo al pico de frecuencia de los virus gripales. A título comparativo, en el año 2017 el pico de circulación de los virus influenza correspondió al periodo situado entre la semana 23 y 28.

Entre los virus gripales identificados el 44% correspondió a Influenza A H1, el 31 % a Influenza B, el 21% a Influenza A H3 y el 4% a virus Influenza A no tipificados. La mediana de edad de los casos de Influenza A H1 es de 7 años con un percentil 25 (p25) de 4 años y un percentil 75 (p75) de 37 años. Para los casos de Influenza A H3 la mediana es de 11 años y la distribución es de 5 y 12 años para el p25 y p75 respectivamente. Los casos de Influenza B integran un grupo de mayor edad con una mediana de 13 años, p25 de 8 años y p75 de 46 años.

El aumento de la circulación de los virus gripales se acompaña de un franco descenso en la detección del VRS (10%) y un aumento de casos detectados con metapneumovirus cuya proporción alcanza también el 10% de los virus respiratorios identificados en la semana 34.

Gráfico 1 - 2018
Gráfico 2 - 2017

Semana 35 (26 de agosto al 1de setiembre 2018)

A partir de la semana 20 (13 al 19 de mayo) comienza una intensa circulación de virus respiratorios en particular el Virus Respiratorio Sincicial (VRS), los virus Parainfluenza y en menor medida el grupo de Coronavirus. En la semana 28, se comienza a detectar los diferentes virus Influenza (Influenza A H3, Influenza A H1 e Influenza B). En la semana 31 (del 29/07 al 4 de agosto) observamos ya una intensa circulación de los virus gripales cuya proporción se incrementa aún más entre las semanas 32 a 34 (12 al 25 de agosto) correspondiendo al pico de frecuencia de los virus gripales. A título comparativo, en el año 2017 el pico de circulación de los virus influenza correspondió al periodo situado entre la semana 23 y 28.

Entre el total de los virus gripales identificados durante este invierno el 39% correspondió a Influenza A H1, el 32 % a Influenza B, el 25% a Influenza A H3 y el 4% a virus Influenza A no tipificados. En esta última semana (semana 35) sin embargo cambia la proporción relativa de los diferentes virus gripales. Influenza A H3 representó el 39% de los virus gripales identificados, Influenza A H1 el 17%, Influenza B el 39% y 5% correspondieron a virus Influenza A no tipificados.

En esta semana 35 la proporción de los otros virus respiratorios es marginal. Salvo los casos de Rhinovirus que representaron el 12%, los demás virus no superaron el 5% del total de los virus identificados durante la semana 35.

Gráfico 1 - 2018
Gráfico 2 - 2017